הגמרא במסכת יומא (כט.) אומרת: "א''ר אסי למה נמשלה אסתר לשחר לומר לך מה שחר סוף כל הלילה אף אסתר סוף כל הנסים והא איכא חנוכה, ניתנה לכתוב קא אמרינן הניחא למאן דאמר אסתר ניתנה לכתוב אלא למאן דאמר אסתר לא ניתנה לכתוב מאי איכא למימר..."
ומביא בעל ה'דף על הדף' : " בקדושת לוי (קדושה שני' לחנוכה) ביאר בזה דלכן לא נתנה חנוכה לכתוב, דהנה הטבע הוא בעצם משועבד לתורה, ואכן בימי מרדכי ואסתר נעשה נס עפ"י דרך הטבע בלי שום פעולה מצדם, כמוש"נ בלילה ההוא נדדה שנת המלך, כי כן ראוי להיות שע"י הטבע יהי' אך טוב לישראל שבשבילם נברא העולם. אולם בימי חנוכה הוצרכו לצאת למלחמה, ונצחו למעלה מדרך הטבע, ולכן אנו קוראין את המגילה בפורים כדי להמשיך אותה דרך שהטבע תעשה את פעולתה לצורך ישראל, משא"כ בנס חנוכה" עכ"ל.

ויש להקשות שהרי היו ניסים שמעל לטבע ונכתבו. לדוגמה, פסח היה מעל לטבע שכן מעולם לא יצא עבד ממצריים, וכן קריעת ים סוף, הטבעת המצרים ופליטת השלל. כמו"כ כל השהות במדבר הייתה נס. ואם כן למה נכתבו שהרי בעל 'קדושת הלוי' אומר שמפני שנס חנוכה היה מעל לטבע לא נכתב?
אשמח לתשובה.